Yhteenveto
Tarina seuraa Medaka Kurokamia, joka on magneettinen ja houkutteleva Hakoniwa-akatemian ensimmäisen vuoden oppilas, joka valittiin ylioppilaskunnan puheenjohtajaksi 98 prosentilla äänistä. Hän käsittelee näitä vetoomuksia epäasianmukaisella tavalla ja perustaa kaikesta lapsuudenkaverinsa Zenkichi Hitoyoshin avusta ehdotuslaatikon. Kertomuksen aikana hän jakaa opiskelijaneuvoston johtamispaikat muille oppilaille, kuten Mogana Kikaijimalle ja Kouki Akunelle.
Opiskelijaneuvosto oppii, että akatemian puheenjohtaja tarkoittaa aloittaakseen tehtävän rutiininomaisten oppilaiden tehokkaaksi kokeilemiseksi, Normaaliksi kutsutun pullo-suunnitelman, jotta voit muuttaa heidät epänormaaleiksi, ihmiseksi, jolla on yli-inhimillisiä voimia. Opiskelijaneuvosto on ristiriidassa muiden työn kanssa mukana olevien oppilaiden kanssa ja tunkeutuu koulun salaiseen laboratorioon.
Pian sen jälkeen Misogi Kumagawa, joka haluaa korvata opiskelijaneuvoston yhdellä omistamastaan Medakasta, haastaa opiskelijaneuvoston mestaruuden. Hänen voimastaan kaksi oppilasta vapautuu Kumagawan tappion jälkeen ja suorittavat kuljetuksen Hakoniwan akatemiaan. Nämä kaksi ovat yleensä vahvempia kuin epänormaalit ja ne kutsutaan nimellä "Ei yhtä". Heidän johtajansa Anshin'in uhkaa käynnistää pullo-suunnitelman uudelleen, kun Medaka astuu luokseen ja ajaa seuraajansa kouluttamaan ylioppilaskunnan. Anshin'inin tarkka strategia olisi kuitenkin se, että hänellä olisi asema Zenkichin ylioppilaskunnan puheenjohtajana Medakaa. Zenkichi onnistuu ja tekee sen teeskentelyllä opiskelijaelämän parantamiseksi. Hän vakuuttaa Medakan sallimaan pullosuunnitelman niille ihmisille, jotka eivät halua.
Medaka otti vastuunsa ylioppilaskunnan presidenttinä ja osallistuu pian mestaruuskilpailuun määrittääkseen miehensä. Medakasta tulee voittaja, joka päättää solmia Zenkichin, kun he molemmat luokittelevat ja tulevat itse. Pian sen jälkeen läheinen kaveri Hansode Shiranui Zenkichistä lähtee koulusta. Zenkichi ja medaka huomaavat, että hänestä tulee toinen isäntä 5000-vuotiaalle Iihiko Shishimelle. Medaka voittaa hänet ja katoaa lopetettuaan kuun kaatumasta kohti maata, yksinkertaisesti ilmestyäkseen uudelleen ajoissa vuoden loppupalvelukseen. Palattuaan oletetaan hänen isänsä asema perheen yritysryhmittymän, Kurokami-ryhmän edessä, palatakseen myöhemmin takaisin, kun uusi puheenjohtaja ja Medaka päättävät jättää akatemian. Kymmenen vuoden kuluttua Zenkichi oli työskennellyt ylöspäin Kurokami-ryhmässä, josta tuli korkean tason työntekijä ennen kuin hän palasi hänen luokseen.