UC 0097, vuosi “Laplace's Box” avaamisen jälkeen.
Huolimatta Universal Century -peruskirjan paljastamisesta, jossa tunnustetaan newtyyppien olemassaolo ja oikeudet, maailman puitteita ei ole muutettu suuresti.
Myöhemmin “Laplace Incidentiksi” kutsutun konfliktin uskotaan päättyneen hihoilla tunnettujen Neo Zeon -jäännösten kaatumiseen. Viimeisessä taistelussaan kaksi täyttä psykokehyksistä koostuvaa matkapuhelinta näytti voimaa, joka ylittää ihmisen ymmärryksen. Valkoinen yksisarvinen ja musta leijona suljettiin pois tämän vaaran poistamiseksi ihmisten tajunnasta, ja ne tulisi nyt unohtaa kokonaan.
Kaksi vuotta aikaisemmin kadonnut RX-0 Yksisarvinen Gundam 03 on kuitenkin nyt jälleen osoittamassa maapalloa. Kultainen Phoenix… nimeltään Phenex.
